Молекулы главного комплекса гистосовместимости класса II

Молекулы главного комплекса гистосовместимости класса II кодируются отдельным набором генов. Эти гены расположены вблизи центромеры и включают несколько локусов. Некоторые из этих генов (DR, DP, DQ) относят к классическим, трансплантационным, принимающим участие в презентации чужеродного антигена, другие же выполняют вспомогательную функцию.

Молекулы МНС класса II экспрессируются в тканях значительно меньше, чем молекулы главного комплекса гистосовместимости класса I. В норме их обнаруживают на поверхности В-клеток, на клетках моноцитарно-макрофагального ряда (эпителиальные клетки Лангерганса, дендритные клетки, эпителий тимуса),  на некоторых Т-клетках.

Молекулы МНС класса II являются мембранными гликопротеинами, построенными из двух полипептидных цепей: α-цепи с молекулярной массой около 33 000 Да и β-цепи с молекулярной массой около 28 000 Да.

α- и β- цепи состоят приблизительно из 230 аминокислотных остатков. Каждая цепь формирует два внеклеточных домена (α1 и α2, β1 и β2), гидрофобную трансмембранную часть и короткий цитоплазматический участок (внутриплазматический "хвост"). Внеклеточные домены молекул главного комплекса гистосовместимости класса II имеют ограниченную гомологию с соответствующими доменами молекул МНС класса I и иммуноглобулинов.

молекулы MHC класса II
молекулы MHC класса II

Молекулы МНС класса II также имеют пептидсвязывающую бороздку, сформированную поровну α1 и β1 доменами α- и β-полипептидных цепей: их α-спирали являются "стенами" бороздки, а антипараллельные β-складки — "дном" бороздки.

В пептидсвязывающих бороздках молекул главного комплекса гистосовместимости класса II также имеются пептиды, в основе образования которых лежит принципиально иной внутриклеточный механизм по сравнению с молекулами МНС класса I.